。曹操无力再战，只得率军退回北方，留下曹仁、徐晃驻守江陵，派乐进镇守襄阳。
此时，甘宁在夷陵被曹仁军队包围，形势危急。周瑜采纳吕蒙的计策，留下凌统率军在正面抵御曹仁，自己亲率一半兵力，火速驰援甘宁，最终大破敌军，胜利而还。同年，孙权也亲自率领大军围攻合肥，同时派张昭攻打九江郡当涂县。张昭出兵不利，未能取胜；孙权围攻合肥，也久攻不下，最终只得率军撤退。
建安十四年（209年），周瑜与曹仁在江陵一带相持已长达一年多。曹仁军孤军无援，死伤众多，无力再守，最终弃城退走。孙权拿下南郡之后，正式任命周瑜为南郡太守，镇守荆州重地。同年，刘备上表朝廷，奏请封孙权代理车骑将军，兼任徐州牧，孙刘联盟进入一段相对和睦的时期。
此后，孙权与刘备在京口相见，两人会晤甚欢，为巩固联盟，孙权同意将南郡等地借给刘备，让刘备有了立足之地。这次会面，进一步巩固了孙刘联盟，使曹操一时之间难以南下。
在此期间，周瑜曾秘密向孙权进言，建议将刘备软禁在吴地，然后趁机调离关羽、张飞，分化瓦解刘备集团，逐步吞并其势力。但孙权认为，曹操在北方虎视眈眈，正应当广纳英雄，又担心刘备难以轻易控制，反而惹火烧身，因此没有采纳。吕范也在刘备拜见孙权之时，秘密建议扣留刘备，孙权同样出于大局考虑，没有听从。
曹操在北方听闻孙权将荆州之地借与刘备，震惊不已，正在写信的他，手中之笔都不觉落在地上。
为了防范孙权南下，曹操后来下令强制迁徙淮南一带的民众，向内迁移。这一举措，反而引发江淮地区十余万户百姓惊慌不安，百姓不愿北迁，纷纷渡过长江，归附孙权，使得江东人口与实力大增。
建安十五年（210年），孙权将目光投向南方广袤的交州，派遣交州刺史步骘率军南征。大军压境之下，交州九郡望风臣服，纷纷归顺江东。交趾太守士燮，率领众兄弟接受孙氏管制，成为江东藩属。只有刘表当年任命的苍梧太守吴巨，表面臣服，暗中违抗，最终被步骘设计斩杀。孙权为了笼络士燮一族，稳定交州，特加封士燮为左将军，加以重用。自此，交州之地，尽归江东。
建安十六年（211年），孙权听从谋臣张纮的建议，认为秣陵山川形胜，有帝王之气，于是将治所迁至秣陵，开始营建新都。
建安十七年（212年），孙权下令修筑石头城，加固城防，并将秣陵正式改名为建业，也就是今天的南京
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